Šiuolaikiniai analizės metodai mikrobiologijoje

Dalyko anotacija lietuvių kalba

Šiuo kursu siekiama pristatyti novatoriškas naująsias technologijas apimant nano-dalelių, nukleino rūgščių, baltymų aptikimo tyrimus. Naujųjų technologijų teorijos ir praktikos pritaikymas mikrobiologiniuose tyrimuose. Nano-dalelių panaudojimo galimybės mikrobiologiniuose tyrimuose. Nano-medžiagų naudojimas mikrobiologinių kultūrų lustams miniatiūrizuojant kultūrų augimą. MALDI-TOF panaudojimo galimybės identifikuojant mikroorganizmų komponentus. Mažamolekulinių metabolitų junginių analizės ir metodų apžvalga.

Dalyko anotacija užsienio kalba

This course aims to introduce innovative new technologies include nano-culture, nucleic acid amplification and detection, protein-based detection. How their technology is may be used in both theory and practice within microbiological research. Explain the possible uses of nanoparticles in microbiological research.
Explain use nanoporous materials, and development of highly subdivided microbial culture chips, with up to a million separate, miniaturized growth areas. Explain the technique of Matrix Assisted Laser Desorption/Ionization Time-of-Flight Mass Spectrometry (MALDI-TOF MS) an its potential application in rapidly identifying microorganisms components. Provide a general overview of the techniques, problems and prospects encountered in the analysis of small metabolite compounds.

Būtinas pasirengimas dalyko studijoms

Analizės metodologija, bioinformatika ir kokybės užtikrinimas; Šiuolaikinės bandinių ir žaliavos paruošimo technologijos

Dalyko studijų rezultatai

1. Gebės atskleisti naujų metabolomikos technologijų vaidmenį mikrobiologijoje
2. Gebės atskleisti mikroorganizmų turinčių ląstelinių riebalų rūgščių ir kitų junginių identifikavimo ir antimikrobinio jautrumo tyrimus
3. Gebės atskleisti amplifikacijos-gamybos-aptikimo metodus mikrobiologijoje
4. Gebės atskleisti biojutiklių technologijas mikrobiologijos studijose
5. Gebės paaiškinti elektroninių nosies prietaisų naudojimo galimybes mikrobiologijoje
6. Gebės paaiškinti mikroorganizmų identifikavimą naudojant masių spektrometriją
7. Gebės atskleisti nanodalelių naudojimo galimybes mikrobiologiniuose tyrimuose

Dalyko turinys

1. Metabolomikos samprata mikrobiologijoje
2. Riebalų rūgščių ir susijusių junginių mikrobiologijoje analizės metodai
3. Tradiciniai ir pažangiausi molekulinės amplifikacijos-gamybos-aptikimo būdai mikrobiologijoje
4. Mikrobiologijoje naudojami biojutikliai. Biojutiklių pritaikymas
5. Elektroninės nosies technologijos
6. Mikroorganizmų identifikavimas panaudojant MALDI-TOF MS
7. Mikrobiologijoje naudojamų nanodalelių technologijos

Dalyko studijos valandomis

Paskaitos 30 val.
Seminarai 15 val.
Laboratoriniai darbai 15 val.
Iš viso kontaktinio darbo val. 60 val.
Savarankiškas darbas 100 val.
Iš viso 160 val.

Studijų rezultatų vertinimas

Kolokviumas raštu (30%), seminarai (15 %), laboratoriniai darbai (15 %), egzaminas raštu (40%)

Literatūra

1. 2014 Yi-Wei Tang Charles W. Stratton Advanced Techniques in Diagnostic Microbiology https://b-ok.cc/book/2196456/666fdd https://www.academia.edu/26969868/
Advanced_Techniques_in_Diagnostic_Microbiology
2. 2012 John P. Hays and W. B. van Leeuwen The Role of New Technologies in Medical Microbiological Research and Diagnosis http://www.eurekaselect.com/50754/volume/1
DOI: 10.2174/97816080531621120101 eISBN: 978-1-60805-316-2, 2012 ISBN: 978-1-60805-565-4
3. 2017 Moghis U. Ahmad Fatty Acids: Chemistry, Synthesis, and Applications https://b-ok.cc/book/3318845/762b86
4. 2016 Jeong-Yeol Yoon Introduction to Biosensors: From Electric Circuits to Immunosensors https://b-ok.cc/book/2677699/c7c8ed
5. 2011 Anders Brandt Noise and Vibration Analysis: Signal Analysis and Experimental Procedures https://b-ok.cc/book/1203545/31cef1
6. 2016 Kostrzewa, Markus, Schubert, Sören MALDI-TOF mass spectrometry in microbiology https://b-ok.cc/book/2836692/76d8f2
7. 2011 Catherine Fenselau1, Plamen Demirev Rapid Characterization of Microorganisms by Mass Spectrometry https://b-ok.cc/book/1177596/5edc44
8. 2015 Dr. Gérrard Eddy Jai Poinern Laboratory Course in Nanoscience and Nanotechnology https://fr.b-ok2.org/book/2533205/66a54a?dsource=recommend
9. 2010 Günter Schmid Nanoparticles From Theory to Application https://b-ok.cc/book/949351/dbe7be
Papildoma literatūra
1. 2018 Altintas, Zeynep Biosensors and nanotechnology : applications in health care diagnostics https://b-ok.cc/book/3419670/01e046
2. 2017 Gharbia, Saheer, Shah, Haroun N MALDI-TOF and tandem MS for clinical microbiology https://b-ok.cc/book/3377454/a7bd04
3. 2006 Charles L.Wilkins Jackson O. Lay, JR Identification of microorganisms by mass spectrometry https://b-ok.cc/book/999078/499ed2