Transkripcinis ankstyvojo kepenų regeneracijos tarpsnio reguliavimas (Biochemija 04 P)
Anotacija
Infekcijos, toksinų ar fizinių veiksnių pažeistos kepenys gali gana greitai atstatyti prarastą audinio masę. Mitozė vyksta tik labai nedidelėje suaugusio organizmo kepenų ląstelių dalyje. Tačiau sumažėjus kepenų masei hepatocitai ima sparčiai proliferuoti. Kepenų gebėjimą regeneruoti lemia sudėtinga augimo veiksnių, citokinų ir kitų ląstelės veiklą reguliuojančių junginių sąveika.
Šiame darbe buvo tiriami genų raiškos pokyčiai žiurkės kepenų ląstelėse pradiniame kepenų regeneracijos tarpsnyje. Genų raiškai nustatyti buvo panaudotos DNR mikrogardelės. Buvo nustatyti 309 genai, kurių raiška patikimai pakinta per pirmąsias 6 valandas po dalinės hepatektomijos operacijos. Nustatytieji 309 genai buvo suskirstyti į šešias grupes pagal laikinius raiškos pokyčius.
PAINT programos pagalba buvo nustatyti 22 transkripcijos veiksniai, galimai lemiantys laikinius genų raiškos pokyčius po dalinės hepatektomijos operacijos.
Devynių transkripcijos veiksnių (NF-κB, GATA-1, HNF-1, C/EBP-α ir C/EBP-β, STAT-3, PAX-6, AP-2α ) aktyvumo pokyčiai buvo įvertinti eksperimentiškai. Nustatyta, kad aktyvių NF-κB, HNF-1 ir C/EBP-β kiekis hepatocitų branduoliuose staigiai padidėja po dalinės hepatektomijos operacijos. Priešingai, aktyvios C/EBP-α formos kiekis sumažėja.
Chromatino imunoprecipitacijos (ChIP) metodu buvo tiriamas NF-κB jungimasis prie Sod2, Mt1a ir Cebpb promotorių sričių praėjus 1 valandai po hepatektomijos. Regeneruojančių kepenų mėginiuose rasta daugiau NF-κB prisijungusio prie Sod2 ir Mt1a promotorių sričių nei kontroliniuose mėginiuose, ryškių pokyčių Cebpb promotoriaus srityje nenustatyta.
