Use this url to cite ETD: https://hdl.handle.net/20.500.12259/123839
Options
Cicindela hybrida ir C. maritima (Coleoptera: Carabidae) vabalų genetinė analizė
Field of Science
Biologija / Biology (N010)
Type of publication
type::text::thesis::master thesis
Title
Cicindela hybrida ir C. maritima (Coleoptera: Carabidae) vabalų genetinė analizė
Other Title
Genetic analysis of cicindela hybrida and C. maritima (Coleoptera: Carabidae) beetles species
Author
Auruszkiewicz, Aurelia |
Advisor
Extent
74 p.
Date Issued
2012-05-31
Abstract
Šio darbo tikslas buvo įvertinti Carabidae šeimos Cicindela hybrida ir C. maritima vabalų genetinę įvairovę Lietuvoje. Molekuliniaims tyrimams buvo panaudoti 157 vabalų pavyzdžių iš 5 skirtingų Lietuvos vietovių: Kuršių nerijos (Grobšto gamtinio rezervato ir Naglių gamtinio rezervato); Šakių r. (Juškinės miško); Kauno r. (Noreikiškių) ir Vilniaus apyl. (Pučkorių atodanga). Tiriant tradiciniais entomologijos metodais ištirti Cicindela hybrida ir C. maritima vabalų rūšių skirtumai. DNR išskyrta iš fiksuotų spirite vabalų kojų, galvos bei krūtinės. DNR išskyrimas iš Cicindela hybrida ir C. maritima rūšies vabalų buvo vykdytas 3 metodais: panaudojant DNR išskyrimo rinkinį „NucleoSpin® Tissue Kit“, panaudojant amoniako tirpalą bei DNR išskyrimo rinkinį „Zymo Research Insect/Tissue DNA Kit-5“. Vabalų genetinės įvairovės tyrimams buvo panaudotos mitochondrinės DNR citochromoksidazės I (COI) geno atkarpą amplifikuojančių pradmenų poros: Pat ®, Jer ir COI-Cic1, COI-Cic4. Nustatyta, kad mtDNR citochromoksidazės (COI) geno atkarpą amplifikuojančių pradmenų poros Pat ®, Jer ir COI-Cic1, COI-Cic4 tinkamos tirti C. hybrida, C. maritima rūšies vabalus. Panaudojant mtDNR citochromo c oksidazės (COI) geno sekų duomenis, nubraižytas C. hybrida ir C. maritima vabalų rūšių NJ (angl., Neighbor-Joining) giminingumo medis bei atlikta vabalų morfologinių struktūrų analizė.
The aim of this study was to evaluate the genetic structure of Cicindela hybrida and C. maritima (Coleoptera: Carabidae) beetles species. 157 beetles from 5 different Lithuanian regions were used in our research: Curonian spit (Grobštas and Nagliai nature reserves), Šakiai district (Juškinė forest), Kaunas district (Noreikiškės) and Vilnius district (Pučkorių exsposure). In the present study Cicindela hybrida and C. maritima species were examined using traditional entomological methods (such as identifying of species, documenting of important for taxonomy morphological structures). DNA was extracted from fixed ethanol specimens usually from leg, head or thorax using the Nucleospin Tissue Kit (Machery-Nagel, Düren, Germany), with ammonia solution and „Zymo Research Insect/Tissue DNA Kit-5“. Two cytochrome c oxidase subunit I (COI) primers were used for polymerase chain reaction: Pat ®, Jer and COI-Cic1, COI-Cic4. MtDNR cytochrome c oxidase (COI) gene primers pair Pat ®, Jer ir COI-Cic1, COI-Cic4 was suitable as the tool for analysis C. hybrida and C. maritima species. Using the data of mtDNA cytochrome c oxidase (COI) gene sequences, the NJ (Neighbor-Joining) relationship tree of Cicindela hybrida and C. maritima beetle species was drawn and the analysis of the morphologic structures of the beettles was conducted.
Language
Lietuvių / Lithuanian (lt)
Defended
Taip / Yes
Access Rights
Atviroji prieiga / Open Access