Sovietų saugumo tarnybos suvokė tautinio veiksnio reikšmę kovoje su Katalikų Bažnyčia Lietuvoje, ypač Vilniaus arkivyskupijoje, kur buvo mėginama pasinaudoti tautine įtampa tarp lietuvių ir lenkų. Nepaisant to, bandymas panaudoti tautinius jausmus kaip atsvarą krikščioniškosioms vertybėms ir Bažnyčios gerovei nepavyko dėl hierarchų, tokių kaip arkivyskupas Mečislovas Reinys, dvasininkų ir katalikų bekompromisės pozicijos. Priešingai saugumo lūkesčiams, lenkų ir lietuvių katalikai netgi susivienijo gindami savo teises. Taip pat kalbama apie mėginimą daryti įtaką popiežiui Jonui Pauliui II, kad jis nustatytų Vilniaus arkivyskupijos ribas Lietuvos TSR teritorijoje. Tai būtų reiškę, jog Apaštalų Sostas pripažįsta sovietų okupaciją Lietuvoje.