Genetic characteristics of the common dormouse (Muscardinus avellanarius) using microsatellites in Lithuania

Abstract

Populiacijų genetinė analizė vis dažniau naudojama siekiant apsaugoti gyvūnus (Broquet, Petit, 2009). Lazdyninė miegapelė (Muscardinus avellanarius) yra graužikų šeimos Gliridae narė (Juškaitis, 2008a). Šie graužikai itin pažeidžiami dėl natūralios aplinkos pokyčių, todėl daugelyje šalių pradėtas miegapelių monitoringas (Bright et al., 2006), bet genetinės analizės duomenų vis dar stinga. Gerai žinoma, kad mikrosatelitai yra naudojami įvertinant natūralių populiacijų genetinę struktūrą (Balloux, Lugon-Moulin, 2002). Šiame tyrime pasitelkėme 5 mik-rosatelitinius pradmenis ir tyrėme 17 lazdyninių miegapelių mėginių iš skirtingų Lietuvos ir Latvijos vietų. DNR tyrėme iš neinvazinių mėginių – plaukų. Gauti rezultatai rodo, kad informatyviausias yra Mav023 pradmuo, turintis 13 alelių, o mažiausia informatyvus – Mav002 su 2 aleliais. Tikėtinas heterozigotiškumas (He) lokuse svyravo tarp 0,5 ir 0,743, o stebimas heterozigotiškumas (Ho) – tarp 0,463 ir 1, išskyrus Mav005 – 0,257

Population genetic analysis becomes more and more popular as a tool to use in animal conservation (Broquet, Petit, 2009). The common or hazel dormouse (Muscardinus avellanarius) is a member of the rodent family Gliridae (Juškaitis, 2008a). These rodents are vulnerable to natural habitat changes, and because of this monitoring of the common dormouse was carried out in many countries (Bright et al., 2006), but there is still lack of genetic data. It is well known that microsatellites are being used to investigate the genetic structure of natural populations (Balloux, Lugon-Moulin, 2002). In our study we used 5 microsatellite primers to investigate 17 common dormouse samples from different places in Lithuania and Latvia. For DNA extraction non-invasive hair samples were used. The results show that the Mav023 primer with 13 alleles is the most informative primer, while the Mav002 primer with 2 alleles is the least informative one. The expected heterozygosity (He) per locus was between 0.5 and 0.743, and the observed heterozygosity (Ho) per locus was between 0.463 and 1, except Mav005 with 0.257