Patogeno indukuojamo superjautrumo atsako reguliacijai reikšmingų Malus genties augalų genų identifikavimas

Abstract

Obelinis rauplėgrybis (Venturia inaequalis (Cke) Wint.) sukelia vieną žalingiausių naminės obels (Malus × domestica Borkh.) ligų. Atsparumą rauplėgrybiui sąlygojančių Malus sp. augalams būdingų genų paieška ir panaudojimas kuriant naminės obels veisles yra vienas pagrindinių obelų selekcijos programų uždavinių. Tyrimo tikslas – identifikuoti V. inaequalis indukuojamo Malus sp. superjautrumo atsako reguliacijai reikšmingus genus, ištirti sąveiką su indukuojamu atsparumu, apibūdinti Malus sp. genofondo atsparumo rauplėms įvairovę. Tyrimo metu sukurtas obels lapų ląstelės branduolių gryninimo metodas mažos apimties obels pavyzdžių proteomos analizei, taikant dvikryptės baltymų elektroforezės metodą, pritaikytas baltymų žymėjimas fluorescuojančiais dažais Dy-560 ir Dy-635. Genų raiškos tyrimams adaptuotas bendrosios RNR paruošimo iš obels lapų metodas. Patogeno indukuojamo obels atsako tyrimams panaudota naminės obels veislių ‘Gala’ ir ‘Golden Delicious’ ląstelių suspensijos kultūra. Atlikus patogeno efektoriaus aktyvuojamo apsauginio atsako tyrimus nustatyta, kad poveikis rauplėgrybio kultūros filtratu stimuliuoja aktyvių deguonies junginių gamybą obels veislės ‘Golden Delicious’ ląstelių suspensijoje. Lyginamosios proteomos analizės metodu buvo identifikuoti 234 baltymai, kuriems būdingi raiškos pakitimai po ląstelių suspensijos inkubacijos su rauplėgrybio kultūros filtratu arba flagelino baltymo fragmentu. Flagelino baltymo fragmentas sukelia didesnio masto genų raiškos pakitimus (211 baltymų) nei poveikis rauplėgrybio kultūros filtratu (158 baltymai). [...]