Characterization of kolomikta kiwi (Actinidia kolomikta) genetic diversity by RAPD fingerprinting

Abstract

RAPD (atsitiktinai amplifikuotos polimorfinės DNR) metodu Kauno botanikos sodo kolekcijoje ex situ buvo tiriama dvidešimt keturių Actinidia kolomikta (Maxim.) Maxim. pavyzdžių genetinė įvairovė. Su 6 pradmenimis, kurių ilgis 10 nukleotidų, amplifikuoti 43 fragmentai, iš kurių 30 (69,8%) buvo polimorfiniai. Trys DNR fragmentai buvo bendri visiems tirtiems pavyzdžiams. Sudaryta dendrograma parodė genetinį tirtų pavyzdžių giminingumo lygį. Veislė ‘Laiba‘ išsiskyrė iš tirtų veislių ir klonų bei buvo mažiausiai jiems gimininga

Twenty-four accessions of Actinidia kolomikta were evaluated by the RAPD method at the Kaunas Botanical Garden collection ex situ for genetic diversity. Six decamer oligonucleotides generated 43 fragments, of which 30 (69.8%) were polymorphic. The UPGMA dendrogram revealed a wide range of genetic variability and a relationship between the accessions. Three fragments were detected in all genotypes. Cultivar Laiba showed the highest GDxy values and was selected as a genetic distinct accession in the A. kolomikta germplasm collection