Žieminių ir vasarinių rapsų (Brassica napus L.) genetinės įvairovės įvertinimas naudojant AAPD analizę
Rapsai (Brassica napus L.) yra svarbi aliejinė kultūra auginama daugelyje šalių, o taip pat ir Lietuvoje, ir naudojami aliejaus gamybai, pašarams, biokurui ir t.t. Kadangi 2006 metais buvo pateiktas prašymas leisti auginti vasarinius GM rapsus lauko sąlygomis mokslo tikslais (BASF Plant Science GmbH), aktualu Lietuvoje įvertinti nulinį genų pasiskirstymo lygį rapsų populiacijų viduje ir išorėje, o taip pat tarp kitų Cruciferae šeimos ir laukinių rūšių. Darbe tirtas žieminių ir vasarinių rapsų genetinis polimorfizmas. Tyrimams surinkti kievienos veislės 10-30 skirtingų individų lapai. Panaudojant polimerazės grandininę reakciją (PGR), atsitiktinai padaugintos polimorfinės DNR metodą (APPD) įvertintas kintamumas. Darbe pasirinkta ir patikrinta 12 pradmenų: OPA-01,OPA-04, OPA-09, OPA-11, 222, 250, 268, 269, 340, 474, 516, 563. APPD duomenys atskleidė didelę rapsų genetinę įvairovę tarp skirtingų veislių ir tos pačios veislės individų.
Oilseed rape (Brassica napus L.) is an important oil crop grown in many countries and also in Lithuania and supplying oil, feed, bio-fuel, etc. As far as a notification was presented about GM spring rape (Brassica napus L.) field trials (BASF Plant Science GmbH) in 2006, it is important to detect the zero level of gene flow within and between oilseed rape populations and individual plants, with other Cruciferae and feral species. Winter and spring rape cultivars were gathered from different region – for 10 to 30 individuals each. RAPD analysis was used in the study. Twelve primers were screened for their ability to produce polymorphic patterns: OPA-01, OPA-04, OPA-09, OPA-11, 222, 250, 268, 269, 340, 474, 516, 563. Dendrograms based on UPGMA cluster analysis confirmed the suitability of all the primers for the further analysis.RAPD data showed a significant genetic variation among oilseed rape of various cultivars and also inside cultivars.