Please use this identifier to cite or link to this item:https://hdl.handle.net/20.500.12259/122838
Full metadata record
DC FieldValueLanguage
dc.contributor.advisorDaugelavičius, Rimantas-
dc.contributor.advisorBamford, Dennis-
dc.contributor.authorPangonytė, Sigita-
dc.date.accessioned2020-12-22T23:15:27Z-
dc.date.available2020-12-22T23:15:27Z-
dc.date.issued2011-06-02-
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/20.500.12259/122838-
dc.description.abstractPadidinto druskingumo aplinkoje gausu halofilinių archėjų ir į virusus panašių dalelių. Halofilines archėjas infekuojantys virusai yra viena iš mažiausiai ištyrinėtų virusų grupių. Šio darbo tikslas ištirti Haloarcula hispanica ląstelių infekcijos skirtingais halovirusais ypatybes ir infekcijos tyrimams pritaikyti potenciometrinius metodus. Darbo metu buvo tyrinėjama Haloarcula hispanica infekcijos halofiliniais virusais: SH1, HHIV2, HHPV1, His1, His2, HHTV1 ir HHTV2 ypatybės. Elektrocheminiais metodais buvo matuojama infekuotų ląstelių membranos įtampa (ΔΨ), kvėpavimo efektyvumas ir membranos laidumas virusinės infekcijos metu. Kvėpavimo slopiklių įtakos Har. hispanica augimo greičio tyrimams naudota KCN, NaN3 ir NaAs. Tyrimo metu mustatyta, kad kvėpavimo slopikliai veikia Haloarcula hispanica ląstelių augimo greitį. 10 mM KCN visiškai sustabdo ląstelių augimą, o veikiant 40 mM NaN3 ląstelių augimo greitis sulėtėja. Skirtingos morfologijos virusų tyrimų rezultatai atskleidė, kad viruso dauginimas efektyvesnis agarizuotoje terpėje: agarizuotoje terpėje padauginto SH1 viruso titras - 4,5*1011 pfu/ml, o skystoje - 3,7*1011 pfu/ml; HHPV1 atveju agarizuotoje terpėje - 1,7*1011 pfu/ml, o skystoje - 4,0*1010 pfu/ml; His2 viruso atveju - atitinkamai 1,2*1012 pfu/ml ir 2,3*1011 pfu/ml. Taip pat buvo nustatyta virusų SH1, HHIV2, His1 ir His2 adsorbcijos koeficientai. Halovirusų adsorbcijos koeficientai nuo virionų morfologijos nepriklauso ir yra intervale nuo 4,5*10-10 iki 2,9*10-13 ml/min. Remiantis vieno infekcinio ciklo eksperimentų rezultatais nustatyta, kad Har. hispanica ląsteles infekuojančių virusų reprodukcinių ciklų trukmė yra nuo 3 iki 10 valandų. Potenciometrinių tyrimų metu gauti duomenys leidžia teigti, kad SH1 ir His2 virusų patekimo į ląstelę mechanizmai skiriasi, kadangi SH1 sukelia infekuojamų ląstelių plazminės membranos depoliarizaciją, tuo tarpu His2 – nesukelia.lt
dc.description.abstractSaline environments are enriched with halophilic archaea and number of virus-like particles. Viruses infecting halophilic archaea are still the worst studied group of viruses. The aim of our studies was to elucidate the infection of Haloarcula hispanica with various morphology viruses and to perform electrochemical on-line monitoring for viral infection analysis. Culture-dependent approaches were used to study Haloarcula hispanica infection with various morphology halophilic viruses: SH1, HHIV2, HHPV1, His1, His2, HHTV1 and HHTV2. Electrochemical measurements were performed to evaluate the changes in membrane voltage (ΔΨ), the efficiency of infected cells respiration and changes in membrane permeability. For evaluation of the influence of the metabolic poisons to the Har. hispanica growth rate KCN, NaN3 and NaAs were used. The results of experiments showed that the inhibitors of respiration repressed the growth. 10 mM of KCN blocked the growth totally, while Har. hispanica growed slowly in 40 mM of NaN3. Various morphology viral infection studies showed that the multiplication of archaeal viruses is effectiveness on soft medium then in a liquid one. SH1 virus titer on soft medium - 4,5*1011 pfu/ml liquid - 3,7*1011 pfu/ml; HHPV1: on soft medium - 1,7*1011 pfu/ml, in liquid - 4,0*1010 pfu/ml; His2 – 1,2*1012 pfu/ml and 2,3*1011 pfu/ml. We determined the adsorption rates of SH1, HHIV2, His1 and His2 viruses too. Halovirus adsorption rate constants varied from 4,5*10-10 to 2,9*10-13 ml/min and the influence of virus morphology on the adsorption rate was negligible. From one-step experiments we found out that the life cycle of halophilic viruses infecting Har. hispanica continues 3 – 10 h depending on the virus. The entry mechanism of virus SH1 differs from His2. SH1 depolarised the membrane of infected cells. At the same time His2 did not cause any changes in depolarisation or permeabilization.en
dc.description.sponsorshipVytauto Didžiojo universitetaslt
dc.format.extent56 p.-
dc.language.isolt-
dc.subjectHaloarcula hispanicalt
dc.subjecthalovirusailt
dc.subjectvirusinė infekcijalt
dc.subjectHaloarcula hispanicaen
dc.subjecthalovirusesen
dc.subjectviral infectionen
dc.subject.otherBiologija / Biology (N010)-
dc.titleHaloarchėjų Haloarcula hispanica virusinė infekcijalt
dc.title.alternativeViral infection of halophilic archaea Haloarcula hispanicaen
dc.typemaster thesis-
item.fulltextWith Fulltext-
item.grantfulltextopen-
crisitem.author.deptBiochemijos katedra-
crisitem.author.deptBiochemijos katedra-
Appears in Collections:VDU, ASU ir LEU iki / until 2018
Files in This Item:
Show simple item record
Export via OAI-PMH Interface in XML Formats
Export to Other Non-XML Formats


CORE Recommender

Page view(s)

7
checked on Jun 6, 2021

Download(s)

38
checked on Jun 6, 2021

Google ScholarTM

Check


Items in DSpace are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.