Patogeninių grybų Leptosphaeria spp. genetinė įvairovė Lietuvoje

Abstract

Fomozė rapsų pasėliuose iki 2001 metų nebuvo labai išplitusi Lietuvoje, tačiau pastaraisiais metais ši liga padaro daug žalos, ypač žieminiuose rapsuose. Todėl buvo pradėti pirmieji tyrimai, siekiant išsiaiškinti Lepthosphaeria maculans rūšių komplekso populiacijos struktūrą. 386 pavyzdžiai surinkti įvairiuose Lietuvos regionuose 2006, 2007, 2009 metais, nuo žieminių rapsų apatinės ir viršutinės stiebo dalies. Rūšiai specifinė PGR analizė, parodė, kad iš surinktų 2006-2007 metais izoliatų visi priklausė L. maculans rūšiai, o 2009 metų izoliatuose aptiktos abi rūšys L. maculans ir L. biglobosa. L. maculans poravimosi tipai pasiskirsė beveik lygiai MAT1-1 turėjo 155 izoliatai, o MAT1-2 tipas aptiktas 162 izoliatuose. Abiejų tipų pasiskirstymas rodo, kad yra paplitęs lytinio dauginimosi būdas. Naudojant AFLP žymenis nustatyta, kad tarp L. maculans izoliatų vyrauja didelė genetinė įvairovė tiek populiacijų viduje, tiek tarp populiacijų. Tokią didelę genetinę įvairovę padeda sukurti lytinis dauginimosi tipas.

Since 2001 phoma stem canker has became a very serious problem in winter oilseed rape in Lithuania. The current study presents the first evaluation of the fungus Leptosphaeria maculans species complex population structure in Lithuania. 386 samples of winter oilseed rape stubble with phoma stem canker symptoms on the crown and upper were collected from different regions in 2006, 2007, 2009 harvest years. Species-specific PCR analysis revealed the presence of only L. maculans isolates in 2006 and 2007 collections while both species - L. maculans and L. biglobosa were detected among the isolates from 2009. The mating types of L. maculans were distributed equally with 155 isolates of MAT1-1 type and 162 isolates of MAT1-2 type. The presence and distribution of both mating types indicate the prevalence of sexual reproduction. High degree of genetic variation among L. maculans isolates as detected with AFLP markers further confirms the high degree of sexual outcrossing.