Pomidorų veislių ir hibridų charakterizavimas, naudojant paprastųjų pasikartojančių sekų molekulinius žymeklius
Pomidorai yra viena dažniausiai auginamų daržovių Lietuvoje ir pasaulyje. Visgi, pasaulyje nėra sukurta universali pomidorų veislė, kuri pasižymėtų visais pageidaujamais požymiais, t. y. būtų gausiai ir anksti deranti, atspari ligoms, nepalankioms klimato sąlygoms. Norėdami sukurti naujas veisles, kurios pasižymėtų minėtais požymiais, pirmiausiai turime gerai pažinti tėvines formas, jų išorinius ir vidinius požymius, genetines savybes. Molekuliniai metodai yra jautrūs ir patikimi, nepriklausantys nuo aplinkos sąlygų, tinkami efektyviai charakterizuoti genetinį polimorfizmą. Lietuvoje sukurtų pomidorų veislių ir linijų polimorfizmas molekulinės biologijos metodais, kurie sudaro galimybes įvertinti jų išskirtinumą, remiantis molekuliniais žymekliais nėra tirtas. Todėl šiame tyrime ištirta 13 pomidorų veislių, 6 hibridai ir jų tėvinės formos taikant paprastųjų pasikartojančių sekų (PPS) molekulinių žymeklių metodą. Remiantis 11 PPS žymeklių, nustatyta, jog alelių skaičius veislėse svyravo nuo 1 iki 5. Tirtų pomodorų veislių polimorfizmo informacijos kiekis (PIC) svyravo nuo 0 iki 0,68. Remiantis PIC nustatyta, jog veislėms identifikuoti labiausiai tinkamos PPS pradmenų poros – Tom236-237, Tom59-60, TMS52. Iš viso pomidorų veislėse nustatyta 12 unikalių alelių. Unikalūs aleliai bei jų deriniai nustatyti ir šešiuose hibriduose ir tėvinėse formose.
Tomatoes are one of the most commonly grown vegetables in Lithuania. However, in the world there is no universal tomato variety with all the desirable traits created, i. e. early in fruit, plentiful harvest, resistant to disease and adverse weather conditions. To create new varieties with the mentioned characteristics, first of all it is important to have a good knowledge of parental forms, their internal and external attributes and genetic characteristics too. Molecular methods are sensitive and reliable, independent of environmental conditions and suitable for effective characterization of genetic polymorphism. The Lithuanian tomato varieties and lines polymorphism using molecular biology techniques based on molecular markers, which enable to assess their distinctiveness has not been studied. The 13 tomato varieties, 6 hybrids and their parental forms were investigated using simple sequences repeats (SSR) method. According to the 11 SSR markers it is showed that in the varieties of tomato the number of alleles ranged from 1 to 5. The tomato varieties polymorphism information content (PIC) ranged from 0 to 0.68. According to the PIC it is found that SSR primers Tom236-237, Tom59-60, TMS52 are the most suitable to identify the varieties of the tomato. In tomato varieties 12 unique alleles were identified. Also, unique alleles and their combinations were identified in hybrids and to parental forms.