| Abstract: | Magistro darbo autorius: Greta Stončaitytė
Magistro darbo vadovas: Dr. Maksim Bratčikov
Magistro darbo pavadinimas: Acinetobacter baumannii karbapenemų OXA–48 genų ir kolistinui atsparių MCR–2, MCR–3, MCR-4, MCR–5 genų paplitimo įvertinimas taikant tikro laiko PGR.
Puslapių skaičius: 45
Lentelių skaičius: 10
Paveikslų skaičius: 17
Darbo tikslas: įvertinti Acinetobacter baumannii karbapenemų OXA–48 genų ir kolistino MCR–2, MCR–3, MCR–4 ir MCR–5 genų atsparumo paplitimą, taikant tikro laiko PGR.
Tyrimo metodai:
Tyrimai buvo atliekami molekulinės medicinos laboratorijoje 2019–2020 m. Darbo metu atlikta izoliatų atranka, kulūros atšviežinimas, kultūros šaldymas, lizatų paruošimas, tiriamosios medžiagos paruošimas TL–PGR analizei, bakterijų ardymas, pradmenų rinkimas ir TL–PGR. Galiausiai paruošėme ir atrinkome 376 izoliatus, kuriuos toliau panaudojome tolimesniems genomo tyrimams.
Bendros išvados:
Šiuo metu bakterijų atsparumas antibiotikams – karbamepenemui ir kolistinui kelia didelį susirūpinimą, nes A. baumannii sukeliamų infekcijų gydymas tampa nebevaldomas. Dėl šios priežasties, genomo tyrimai gali padėti kuo greičiau užkirsti kelią plisti šios bakterijos padermės, taip sustabdydami A. baumannii sukeliamų kraujo, inkstų takų ir žaizdų infekcijas.
Author of the master thesis: Greta Stončaitytė
Manager of the thesis: Dr. Maksim Bratčikov
Name of the thesis: Evaluation of the prevalence of Acinetobacter baumannii carbapenem OXA-48 genes and colistin resistance of MCR-2, MCR-3, MCR-4, MCR-5 genes by real-time PCR
Number of pages: 45
Number of tables: 10
Number of figures: 17
Purpose of the work: to evaluate evaluation of the prevalence of Acinetobacter baumannii carbapenem OXA-48 genes and colistin resistance of MCR–2, MCR–3, MCR–4, MCR–5 genes by real-time PCR.
Methods used:
The research has been conducted in years 2019¬–2020 at a microbiology laboratory. In this research we have conducted selection of isolates, as well as refreshment and freezing of its culture, preparation of lysates, as well as preparation of the test substance for the TL-PGR analysis, TL-PGR and collection of the primers. Lastly, we have prepared and selected 376 isolates, which were further used for the research of its genome.
Findings:
At the time of this research bacteria resistance to antibiotics – carbapenem and colistin are concerning, as treatment for the infections, caused by A. baumannii is becoming no longer manageable. Thus, further research of the genomes could facilitate the process of finding ways of halting the spread of the before mentioned bacteria strain, stopping infections of the blood, renal pathways or wounds, caused by A. baumannii. |
