Please use this identifier to cite or link to this item:https://hdl.handle.net/20.500.12259/107480
Type of publication: bachelor thesis
Field of Science: Chemijos inžinerija / Chemical engineering (T005)
Author(s): Griciūtė, Gabija
Supervisor: Radzijevskaja, Jana
Title: Bartonella spp. identifikavimas utėlėse panaudojant rpoB ir ITS regiono sekų analizę
Other Title: Bartonella spp. identification in louse by using rpoB and ITS regions sequence analysis
Extent: 41 p.
Date: 18-Jun-2020
Keywords: Bartonella;Bartonella;utėlės;Lice;rpoB genas;rpoB gene;ITS regionas;ITS region
Abstract: Tyrimai atliekami su Bartonella bakterijomis yra svarbūs dėl šių patogenų paplitimo tarp graužikų ir kitų laukinių bei naminių gyvūnų ir jų ektoparazitų. Bartonella bakterijos gali sukelti įvairaus sunkumo ligas žmonėms, o komplikacijos gali išlikti visą gyvenimą. Bartonella patogenų identifikacija taip pat svarbi ištirti naujas rūšis bei jų plitimą anksčiau neužkrėstuose regionuose ar žemynuose. Šio darbo tikslas yra identifikuoti Bartonella bakterijų rūšis utėlėse, surinktose nuo smulkiųjų graužikų Slovakijoje, naudojantis molekuliniais tyrimo metodais. Rūšių identifikavime buvo tirtos 5 utėlių rūšys: Huebneria affinis, Pyroteuthis serrata, Polyplax spinulosa, Hoplopleura sp., Hoplopleura acanthopus, surinktos iš Apodemus agrarius, Apodemus flavicollis, Microtus arvalis ir Myodes glareolus graužikų. Bartonella rūšių identifikavimui buvo gausinami rpoB geno ir ITS regiono sekų fragmentai atliekant PGR. Amplifikuoti rpoB geno ir ITS regiono PGR produktai buvo išvalomi ir sekvenuojami. Gautos sekos buvo analizuojamos naudojant Mega X programą. Atliekant rpoB geno ir ITS regiono sekų analizę nustatytos 3 Bartonella rūšys: Bartonella coopersplainsensis, Bartonella tribocorum ir Bartonella taylorii. Užsikrėtimas B. coopersplainsensis nustatytas 7 H. affinis utėlių mėginiuose, B. taylorii nustatyta 1 H. affinis mėginyje ir B. tribocorum identifikuota 2 H. affinis bei 1 P. serrata mėginyje.
Studies done with Bartonella bacteria are important as these pathogens are very common between domestic and wild animals (including rodents) and their ectoparasites. Bartonella bacteria can cause serious diseases in humans and complications can last for the rest of the life. As well, identification of Bartonella pathogens is important to identify new species and its spreading to new regions or continents. The aim of this study was to identify Bartonella bacteria species by using molecular methods in lice. They were collected from small rodents in Slovenia. In identification of Bartonella species 5 lice species were investigated: Huebneria affinis, Pyroteuthis serrata, Polyplax spinulosa, Hoplopleura sp., Hoplopleura acanthopus. Lice were collected from rodents identified as Apodemus agrarius, Apodemus flavicollis, Microtus arvalis and Myodes glareolus. Bartonella species identification was based on amplification of partial rpoB gene and ITS region. Amplified rpoB gene and ITS region PCR products were purified and sequenced. Obtained sequences were analyzed by using Mega X software. Sequence analysis allowed to identify three Bartonella species: Bartonella coopersplainsensis, Bartonella tribocorum and Bartonella taylorii. B. coopersplainsensis infection was identified in 7 H. affinis lice samples, B. taylorii was identified in 1 H. affinis sample and B. tribocorum in 2 H. affinis as well as in 1 P. serrata samples.
Internet: https://hdl.handle.net/20.500.12259/107480
Appears in Collections:2020 m. (GMF bak.)

Files in This Item:
Show full item record
Export via OAI-PMH Interface in XML Formats
Export to Other Non-XML Formats


CORE Recommender

Page view(s)

30
checked on Jun 6, 2021

Download(s)

33
checked on Jun 6, 2021

Google ScholarTM

Check


This item is licensed under a Creative Commons License Creative Commons