Lietuvos balinių vėžlių populiacijos (Emys orbicularis) sekų genetinė analizė panaudojus citochromo b geno molekulinius žymenis
Balinis vėžlys (Emys orbicularis) yra viena rečiausių Lietuvos roplių faunos rūšių, kuri nuo 1976m. įrašyta į Lietuvos raudonąją knygą. Taip pat balinis vėžlys yra nykstanti ir saugoma rūšis ne tik Lietuvoje, bet ir daugelyje ES šalių, tačiau genetiniai tyrimai per pastarąjį dešimtmetį buvo įvertinti ir atlikti tik užsienio šalyse. Todėl yra svarbu atlikti tyrimus, nes nustačius populiacijos filogeniją ir genetinės įvairovės vertę, galima teikti siūlymus ir rekomendacijas rūšies išsaugojimo projektams ir taip prisidėti prie šios nykstančios rūšies išsaugojimo. Šio tyrimo tikslas yra ištirti Lietuvos balinio vėžlio (Emys orbicularis) haplotipus, porūšį ir sekų genetinę įvairovę panaudojus citochromo b geno molekulinius žymenis ir gautus rezultatus palyginti su užsienio šalių balinių vėžlių sekomis. Atlikus mtDNR analizę nustatyta, kad Lietuvoje gyvenantys baliniai vėžliai priskiriami Emys orbicularis orbicularis porūšio grupei, haplotipui Ia. Tiek porūšis, tiek haplotipas pagal geografinį pasiskirstymą priklauso Rytų Europos arealui. Atlikus sekų genetinę analizę nustatyta, kad Lietuvoje gyvenančių balinių vėžlių sekos nėra konservatyvios, vienoje (sK8) iš keturių sekų nustatyta vieno nukleotido mutacija 1003 pozicijoje (timino pokytis į adeniną). Palyginus su kitų šalių balinių vėžlių sekomis atitikmenų nerasta, todėl galima teigti, kad yra nustatytas unikalus haplotipas. Visose sekose citozino ir adenino nukleobazių yra daugiausia, o guanino nukleobazės dažnis buvo mažiausias. Taip pat atlikus palyginimą su kaimyninių šalių balinių vėžlių sekomis nustatyta, kad Lietuvoje gyvenantiems baliniams vėžliams priskiriamas haplotipas Ia yra paplitęs tiek Latvijoje, tiek Lenkijoje. Tarp kaimyninių šalių haplotipų geografinis pasiskirstymas nėra išreikštas, todėl pasakyti, kurios šalies baliniai vėžliai pagal cytb geno sekas yra artimesni Lietuvos baliniams vėžliams, negalima.
European Pond turtle (Emys orbicularis) is one of the rarest species of Lithuanian reptile fauna that has been listed in the Lithuanian Red Book since 1976. Also, the pond turtle is an endangered and protected species not only in Lithuania but also in many EU countries, but genetic research has been evaluated and performed only in foreign countries. It is therefore important to carry out research, because by determining the phylogeny of a population and the value of genetic diversity, it is possible to make suggestions and recommendations for conservation projects of the species. The aim of this study was to investigate the haplotypes, subspecies and genetic diversity of European pond turtle (Emys orbicularis) in Lithuania using cytochrome b gene molecular markers and to compare the obtained results with foreign European pond turtle sequences. It was determined that the European pond turtle in Lithuania belong to the subspecies of Emys orbicularis orbicularis, haplotype Ia. Both the subspecies and the haplotype belongs to the Eastern European range. Genetic analysis of the sequences revealed that in Lithuania European pond turtles sequences were not conservative, one (sK8) of the four sequences showed a single nucleotide mutation at position 1003 (thymine change to adenine). No matches were found compared to other pond turtle sequences, so it can be said that a unique haplotype has been identified. In all sequences, cytosine and adenine nucleobases were most numerous, while the frequency of guanine nucleobases was the lowest. Also, a comparison with the sequences of European pond turtles in neighboring countries revealed that haplotype Ia, which belongs to pond turtles in Lithuania, is widespread in both Latvia and Poland. The geographical distribution of haplotypes between neighboring countries is not expressed, therefore it is not possible to say which country's European pond turtles are closer to European pond turtles in Lithuania according to the cytb gene sequences.