Vektorių pernešamų patogenų molekulinis identifikavimas barsukuose
Baltrušaitytė, Karolina |
Barsukai (Meles meles) vaidina reikšmingą epidemiologinį vaidmenį platinant įvairius virusus, bakterijas bei parazitus (endo ir ektoparazitus). Dėl to šie gyvūnai ne tik suserga patys, tačiau ir tampa įvairių patogenų rezervuarais bei pernešėjais. Šio darbo metu tiriamas 8 barsukų (Meles meles) užsikrėtimas Anaplasma phagocytophylium, Babesia spp., Bartonella spp., Borrelia spp., Neoehrlichia mikurensis, Ehrlichia spp., Hepatozoon spp., Mycoplasma spp., Rickettsia spp. patogenais. Tyrimui naudojami iš barsukų blužnies audinių išskirti mėginiai. Patogenų identifikavimui naudojami tikro laiko ir lizdinės PGR metodai bei filogenetinė analizė. 62,5 % barsukai (5/8) buvo užsikrėtę Babesia spp.,, patogenų sekų analizės rezultatai parodė, jog gautos sekos yra genetiškai artimos su A tipo Babesia sp. mėginiais aptiktais barsukuose Kinijoje, Ispanijoje bei Didžiojoje Britanijoje. Tai rodo, ne mažą šio parazito paplitimą barsukuose. 12,5 % (1/8) tirtų barsukų nustatyta Anaplasma phagocytophylium. Atlikta analizė parodė, kad sekoskaitos metu gautas mėginys 97,25 % tarpusavyje sutapo su mėginiais iš kitų šalių - Čekijos ir Švedijos. Taip pat, 12,5 % (1/8) barsukų buvo užsikrėtę Mycoplasma spp. bakterija, filogenetinės analizės metu nusekvenuotas mėginys 100 % parodė giminingumą su sekomis iš Vokietijos bei Serbijos. Tuo tarpu Bartonella spp., Borrelia spp., Neoehrlichia mikurensis, Ehrlichia spp., Hepatozoon spp., Rickettsia spp. teigiamų mėginių nenustatyta. Šis tyrimas yra vienas pirmųjų Lietuvoje, kuriame molekuliniais metodais nustatytas barsukų užsikrėtimas patogenais, taip pat atliktas identifikuotų patogenų rūšinės ir genetinės įvairovės vertinimas.
Badgers (Meles meles) play a significant epidemiological role in spreading various viruses, bacteria and parasites (endo and ectoparasites). As a result, these animals not only get sick themselves, but also become reservoirs and carriers of various pathogens. In this work, the infection of 8 badgers (Meles meles) with the pathogens Anaplasma phagocytophilium, Babesia spp., Bartonella spp., Borrelia spp., Neoehrlichia mikurensis, Ehrlichia spp., Hepatozoon spp., Mycoplasma spp., Rickettsia spp. is studied. Samples isolated from badger spleen tissues are used for the study. Real time and nested PCR methods and phylogenetic analysis are used to identify pathogens. 62.5 % of badgers (5/8) were infected with Babesia spp., the results of pathogen sequence analysis showed that the obtained sequences are genetically close to type A Babesia sp. samples detected in badgers in China, Spain and United Kingdom. This indicates that the prevalence of this parasite in badgers is not small. Anaplasma phagocytophilium was detected in 12.5 % (1/8) of the badgers examined. The analysis showed that the sample obtained during sequencing had 97.25 % similarity with samples from other countries - the Czech Republic and Sweden. Also, 12.5 % (1/8) of the badgers were infected with Mycoplasma spp. bacteria, and the phylogenetic analysis showed 100 % similarity with sequences from Germany and Serbia. Meanwhile, no positive samples were found for Bartonella spp., Borrelia spp., Neoehrlichia mikurensis, Ehrlichia spp., Hepatozoon spp., Rickettsia spp. This study is one of the first in Lithuania to use molecular methods to determine the infection of badgers with pathogens, as well as to assess the species and genetic diversity of the identified pathogens.