Please use this identifier to cite or link to this item:https://hdl.handle.net/20.500.12259/124014
Type of publication: master thesis
Field of Science: Biologija / Biology (N010)
Author(s): Gyvytė, Ugnė
Title: Su kolorektalinio vėžio patogeneze siejamų COX2, VEGFA, HUR ir CUGBP2 genų raiškos analizė
Other Title: COX2, VEGFA, HUR and CUGBP2 expression analysis in colorectal cancer
Extent: 73 p.
Date: 29-May-2014
Keywords: kolorektalinis vėžys;genų raiška;neoadjuvantinis gydymas;colorectal cancer;gene expression;neoadjuvant treatment
Abstract: Kolorektalinis vėžys (KRV) – tai trečias pagal dažnumą vėžinis susirgimas pasaulyje, kurio didžiausi sergamumo dažniai fiksuojami labiau išsivysčiusiose pasaulio šalyse. Žinoma, kad KRV patogenezė yra daugiaetapis procesas, kuriam svarbi tiek aplinkos, tiek ir genetinių faktorių sąveika. Pastarųjų metų tyrimai parodė, kad COX2, VEGFA, HUR ir CUGBP2 genai ir jų produktai dalyvauja skirtingų vėžio tipų, tarp jų ir KRV, patogenezėje, o jų raiška vėžiniuose audiniuose yra susijusi su auglio atsaku į spindulinę (ST) ir chemospindulinę (chST) terapiją. Taigi šio darbo tikslas yra įvertinti COX2, VEGFA, HUR ir CUGBP2 reikšmę KRV patogenezėje bei nustatyti šių genų tinkamumą neoadjuvantinio ST ir chST gydymo prognozei bei efektyvumo nustatymui. Šio tyrimo metu, tikro laiko kiekybinės atvirkštinės transkripcijos polimerazinės grandininės reakcijos (AT-PGR) metodu, buvo nustatyta COX2, VEGFA, HUR ir CUGBP2 genų iRNR santykinė raiška 37 pacientų storosios žarnos audiniuose bei įvertinta jų prognostinė vertė atsako į gydymą nuspėjimui. Tiriamųjų genų raiškos pokyčių sąsajos su gydymo efektyvumu nustatytos įvertinius jų raišką 12 pacientų KRV audiniuose, prieš ir po ST ir chST taikymo. Statistinė genų raiškos analizė atlikta naudojant ΔCT ir ΔΔCT santykinės kiekybinės analizės metodus, Stjudento t, Mann-Whitney ir ANOVA testus. Tyrimo rezultatai parodė padidėjusią COX2 ir VEGFA genų koduojamos iRNR raišką vėžiniuose kolorektaliniuose audiniuose, palyginus su šalia esančiu nevėžiniu audiniu. Tačiau reikšmingų sąsajų tarp šių genų raiškos prieš terapijos taikymą ir atsako į gydymą neaptikta. COX2, VEGFA, HUR ir CUGBP2 genų iRNR raiškos analizė KRV audiniuose po neoadjuvantinės terapijos parodė reikšmingą HUR iRNR lygio sumažėjimą po ST ar chST taikymo. HUR raiškos sumažėjimas terapijos poveikyje taip pat susietas su geresniu atsaku gydymą. Mūsų tyrimas patvirtino COX2 ir VEGFA genų dalyvavimą KRV patogenezėje bei parodė galimą HUR geno raiškos pokyčių svarbą neoadjuvantinio gydymo efektyvumo įvertinimui.
Colorectal cancer (CRC) is the third most common cancer worldwide, with a higher morbidity in more developed regions. The mechanisms of CRC development appear to be complex: both lifestyle, dietary and genetic factors contribute to CRC pathogenesis. Recent studies have demonstrated that COX2, VEGFA, HUR and CUGBP2 genes are involved in carcinogenesis of several different types of tumours, as well as CRC, and their expression in tumour tissues is associated with the outcome of neoadjuvant treatment. The aim of this study was to evaluate the role of COX2, VEGFA, HUR and CUGBP2 genes in CRC pathogenesis and their prognostic and predictive value for the outcome of neoadjuvant treatment. In this sudy we evaluated the expression of COX2, VEGFA, HUR and CUGBP2 mRNA in pretherapeutic CRC tissues of 37 patients using real time quantitative RT-PCR method, and examined the relation between their mRNA expression and the outcome of neoadjuvant treatment. We also measured the expression of target genes mRNA in 12 potstherapeutic CRC tissues and related the change of expression with the efficiency of radio- or chemoradiotherapy. Gene expression analysis was done using ΔCT and ΔΔCT methods, Student‘s t-test, Mann Whitney and ANOVA statistical analysis tests. The results demonstrated a significantly higher COX2 and VEGFA mRNA expression in CRC tissues comparing with paired adjacent normal tissue. However, no relations with the outcome of treatment was observed. Expression analysis in posttherapeutic tissues revealed a significant decrease of HUR gene expression after neoadjuvant therapy and these changes were related with a higer efficiency of treatment. In this study we claim that COX2 and VEGFA genes are involved in pathogenesis of CRC. The changes in HUR gene expression after neoadjuvant radio- and chemoradiotherapy might be an important factor for the evaluation of treatment efficiency.
Internet: https://hdl.handle.net/20.500.12259/124014
Affiliation(s): Vytauto Didžiojo universitetas
Appears in Collections:VDU, ASU ir LEU iki / until 2018

Files in This Item:
Show full item record
Export via OAI-PMH Interface in XML Formats
Export to Other Non-XML Formats


CORE Recommender

Page view(s)

9
checked on Mar 30, 2021

Download(s)

3
checked on Mar 31, 2021

Google ScholarTM

Check


Items in DSpace are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.