Rengti mokslininkus, gebančius savarankiškai atlikti mokslinių tyrimų ir eksperimentinės plėtros darbus bei spręsti mokslo problemas, yra viena iš esminių universiteto misijų. Šioje veiklos kryptyje siekiama, kad universitete rengiami jaunieji mokslininkai kryptingai ir sėkmingai integruotųsi į nacionalinę ir tarptautinę mokslo aplinką ir išsiugdytų darbo rinkai reikalingus įgūdžius ir gebėjimus, sudarančius galimybes jiems dirbti tarpdalykinėse, tarpinstitucinėse ir tarptautinėse tyrėjų komandose.

Universitete doktorantams sudaromos palankios sąlygos ne tik studijuoti, gilinti konkrečios mokslų krypties teorines bei metodologines žinias įvairiuose seminaruose ir doktorantūros mokyklose, atlikti savarankiškus mokslinius tyrimus, bet ir dalyvauti tarptautinės reikšmės moksliniuose projektuose, stažuotėse užsienyje, dėstyti paskaitas bei vesti seminarus VDU bei partneriniuose universitetuose.

1989 m. atkūrus Vytauto Didžiojo universitetą, doktorantūros studijos pradėtos vykdyti po ketverių metų. Per beveik 20 metų Lietuvos ir pasaulio mokslininkų gretas papildė beveik 500 jaunų bei perspektyvių mokslo daktarų. Šiuo metu doktorantūros studijose studijuoja šiek tiek daugiau nei 300 doktorantų. 

2011 m. universitetui įgijus doktorantūros teisę 18-oje mokslo krypčių kartu su kitomis Lietuvos bei užsienio aukštojo mokslo ir tyrimų institucijomis, doktorantūros studijos buvo iš esmės atnaujintos –  jos tapo jungtinės ir tarpinstitucinės. Kiekvienoje mokslo kryptyje buvo sutelktos ir apjungtos geriausių šalies (o kai kuriose kryptyse – ir užsienio) mokslininkų pajėgos bei sukurti įvairių mokslo krypčių doktorantūros studijų tinklai. Šis inovatyvus doktorantūros studijų modelis įgalina konsoliduoti geriausią dalyvaujančių institucijų mokslinį potencialą, žinias ir patirtį, naudoti bendrą institucijų infrastruktūrą ir išteklius, efektyviau spręsti tyrimų kokybės klausimus, įgalinti didesnę vidinę ir išorinę mokslinę kritiką, atvirumą ir nešališkumą, padeda išvengti temų ir tyrimų dubliavimo, skatina drauge koordinuoti įvairaus pobūdžio tyrimus bei užtikrinti aukščiausią jų kokybę.

Vytauto Didžiojo universiteto partnerės, organizuojant doktorantūros studijas, yra 25 Lietuvos bei užsienio aukštojo mokslo ir tyrimų institucijos –  Kauno technologijos, Šiaulių, Klaipėdos, Mykolo Riomerio, Lietuvos sveikatos mokslų, Vilniaus, Lietuvos edukologijos, ISM Vadybos ir ekonomikos, Europos humanitarinis, Aleksandro Stulginskio universitetai, Generolo J. Žemaičio Lietuvos karo akademija, Gamtos tyrimų centras, Valstybinio mokslinių tyrimų instituto Inovatyvios medicinos centras, Lietuvos agrarinių ir miškų mokslų, Lietuvos socialinių tyrimų centrai, Lietuvos istorijos, Lietuvių kalbos, Lietuvos kultūros tyrimų institutas, Agder universitetas (Norvegija), Latvijos universitetas (Latvija), Nencki Eksperimentinės biologijos institutas (Lenkija), Aveiro universitetas (Portugalija), Cordobos universitetas (Ispanija).

Priėmimą į doktorantūros studijas organizuoja ir daugiau informacijos teikia Mokslo tarnyba.

Priėmimo į doktorantūros studijas sąlygos skelbiamos skiltyje „Priėmimas į doktorantūros studijas“.

Apie doktorantūros studijas trumpai

• 1993 m. – pradedamos vykdyti doktorantūros studijos Vytauto Didžiojo universitete.
• 2011 m. birželio 8 d. Švietimo ir mokslo ministro įsakymu buvo patvirtinta, kad Vytauto Didžiojo universitetas drauge su partnerinėmis institucijiomis gavo doktorantūros teisę 14 mokslo krypčių.
• 2011 m. birželio 21 d. Švietimo ir mokslo ministro įsakymu VDU suteikta teisė organizuoti doktorantūros studijas papildomose 4 mokslo kryptyse.
• 1993–2012 m. universitete apgintos 523 daktaro disertacijos.
• 2012 m. rudens semestre Vytauto Didžiojo universiteto doktorantūros programose studijavo: 213 dieninių/nuolatinių studijų doktorantai, 7 nuolatinių studijų doktorantai, finansuojami Europos Sąjungos lėšomis pagal nacionalinę kompleksinę programą, 21 nuolatinių studijų doktorantų, finansuojamų Europos Sąjungos lėšomis pagal tyrėjų kompleksinę programą, 18 universiteto lėšomis finansuojamų nuolatinių studijų doktorantų, 41 ištęstinių / neakivaizdinių studijų doktorantas, 1 universiteto lėšomis finansuojamas ištęstinių studijų doktorantas ir 5 eksternai.